Ο χριστιανισμός του Yaquis ήταν αυτό που επέτρεψε στον θρησκευτικό να εξαπλωθεί το 1609, διεισδύοντας στο έδαφος της Sonora.
Κατά τη διάρκεια της αποικίας, η Sonora αντιστοιχούσε μόνο στις πλαγιές του Sierra Madre Occidental εντός των ορίων αυτής της οντότητας. Η περιοχή που έτρεχε βόρεια από τον ποταμό Yaqui, συμπεριλαμβανομένου του Real de la Cieneguilla, ονομάστηκε Pimería Baja και η βορειότερη περιοχή από αυτό το Real έως τον ποταμό Κολοράντο - ήδη στην τρέχουσα πολιτεία της Αριζόνα της Βόρειας Αμερικής - ονομάστηκε Pimería Alta.
Η σημερινή επικράτεια Sonoran περιλαμβάνει επίσης μια μικρή περιοχή στα νοτιοδυτικά αυτού που τότε ήταν γνωστό ως Pimería, που βρίσκεται στην πολιτεία Chihuahua και Ostimuri, ένα μέρος που βρίσκεται στις ακτές του Κόλπου της Καλιφόρνιας, μεταξύ των ποταμών Mayo και Yaqui.
Το 1614 οι ιεραπόστολοι Pérez de Rivas και Pedro Méndez εκχριστιανίζουν τους Μάγια στην περιοχή Ostimuri, χωρίζοντας την αποστολή σε τρεις περιοχές: Santa Cruz (στις εκβολές του Mayo), Navojoa και Tesia.
Οι Tepahues ενσωματώθηκαν μαζί με τους Cornicaris το 1620. Ο πατέρας Miguel Godínez ίδρυσε τις αποστολές των San Andrés de Cornicari και Asunción de Tepahui . Την ίδια χρονιά ιδρύθηκε η Πρυτανεία του San Ignacio, η οποία περιελάμβανε, εκτός από τις πέντε προαναφερθείσες αποστολές, εκείνες των Bacúm, Torín και Rahún, που βρίσκονται στις εκβολές του Yaqui.
Το 1617 το Yaquis μετατράπηκε από τους γονείς Pérez de Rivas και Tomás Basilio. Παρά τις ταραχές, τις ταραχές, τα βασανιστήρια και τις ανθρωποκτονίες, η μετατροπή του Sonora ήταν ταχύτερη και πιο σταθερή. Μέχρι τον 17ο αιώνα, οι Ιησουίτες επεκτάθηκαν και ίδρυσαν την αποστολή Maycoba και Yecora στο νοτιοδυτικό τμήμα αυτού που γνώριζαν ως Chínipas.
Οι αποστολές από τον ποταμό Yaqui στο βορρά χωρίστηκαν σε τέσσερα rectories: αυτή του San Borja ομαδοποίησε τις αποστολές: Cucumaripa και Tecoripa , ιδρύθηκε το 1619 · Movas and Onovas, το 1622; Sahuaripa το 1627; Matape το 1629; Onapa το 1677 και Arivechi , το 1727. Η Πρυτανεία των Τριών Ιερών Μαρτύρων της Ιαπωνίας που περιλάμβανε τον Batuco ιδρύθηκε το 1627, το Oposura το 1640 και το Bacadeguachi , Γκουαζάβας , Santa María Baceraca και San Miguel Bavispe , ιδρύθηκε το 1645. Και η Πρυτανεία του Σαν Χαβιέ που ενσωμάτωσε τις αποστολές του Ουρές το 1636. Aconchi, Opodepe και Banámichi το 1639; Cucurpe και Arizpe το 1648 και Cuaquiárachi το 1655.
Το 1687 ο ιεραπόστολος Eusebio Francisco Kino μπήκε στην Pimería Alta και ξεκίνησε τις αποστολές του Πρύτανη της Nuestra Señora de los Dolores, ιδρύοντας: Caborca, στην οποία ανατέθηκε ο Francisco Javier Saeta ο οποίος διατηρεί αλληλογραφία με την πνευματική του υποστήριξη, ο πατέρας Κίνο; Atil, Tubutama, Η Παναγία των Θλίπων από το Σάριτς, το Pitiquito, Aiil, Oquitoa, Magdalena, San Ignacio, Cocóspera και Imuris.
Μετά την απέλαση των Ιησουιτών, οι αποστολές ήταν υπεύθυνες για τους Φραγκισκανούς, οι οποίοι δεν χτίστηκαν πια και περιορίστηκαν μόνο στην προσπάθεια διατήρησης των υπαρχόντων. Μόλις οι Ιησουίτες είχαν ήδη ιδρύσει οικισμούς στη Σιναλόα και στη Σονόρα, στράφηκαν τα μάτια τους στο έδαφος της Καλιφόρνιας.
