Γεννημένος στο Ozumba, Πολιτεία του Μεξικού, το 1737, αγκάλιασε μια θρησκευτική καριέρα και χειροτονήθηκε ιερέας σε ηλικία είκοσι ετών.
Παρά τη φιλοσοφική του κατάρτιση, από πολύ μικρή ηλικία ασχολήθηκε με τη γνώση και την εφαρμογή των φυσικών επιστημών, της φυσικής, των μαθηματικών και της αστρονομίας. Δημοσιεύει πολύτιμα έργα επιστημονικών θεμάτων στις εφημερίδες και τα περιοδικά της εποχής του. Αποκτά διεθνή φήμη και ορίζεται αντίστοιχος συνεργάτης της Ακαδημίας Επιστημών του Παρισιού. Αφιερώνει μεγάλο μέρος του χρόνου διεξαγωγής επιστημονικών πειραμάτων και συγκεντρώνει μια τεράστια βιβλιοθήκη. Είναι συλλέκτης αρχαιολογικών κομματιών και σπάνιων δειγμάτων φυτών και ζώων. Εξερευνήστε το Xochicalco. Για να τον αποτίσουμε φόρο τιμής, το 1884 ιδρύθηκε η Επιστημονική Εταιρεία Antonio Alzate, η οποία το 1935 έγινε η Εθνική Ακαδημία Επιστημών. Το πιο γνωστό συντακτικό του έργο είναι οι σημειώσεις στην Αρχαία Ιστορία του Μεξικού του Jesuit Francisco Javier Clavijero. Λέγεται ότι είναι μακρινός συγγενής του Sor Juana Inés de la Cruz. Πέθανε στην Πόλη του Μεξικού το 1799.
