Η ιστορία της πόλης που αρχικά ονομαζόταν το Βασίλειο της Νέας Γαλικίας συνεχίζεται.
Υπάρχει επίσης το παλιό κολλέγιο Jesuit του Santo Tomás de Aquino, που χτίστηκε την τελευταία δεκαετία του 16ου αιώνα και το 1792 καταλήφθηκε από το Πανεπιστήμιο. Από την κατασκευή, παραμένει μόνο η εκκλησία, με τον μνημειακό τρούλο του από τον περασμένο αιώνα, και το συνημμένο παρεκκλήσι Loreto, που χτίστηκε το 1695 από τον Juan María de Salvatierra. Ο ναός του San Juan de Dios, που ήταν παλαιότερα το παρεκκλήσι της Santa Veracruz, που χτίστηκε τον 16ο αιώνα από τον Don Pedro Gómez Maraver, χτίστηκε τον 18ο αιώνα με μια μπαρόκ πρόσοψη με νηφάλια χαρακτηριστικά. Η εκκλησία της La Merced, με μπαρόκ στιλ παρόμοια με εκείνη του San Juan de Dios, αν και πιο περίτεχνα, ιδρύθηκε τον 17ο αιώνα από τους φλόγους Miguel Telmo και Miguel de Albuquerque.
Ο Ναός της La Soledad χτίστηκε στα τέλη του 17ου αιώνα και στις αρχές του 18ου αιώνα κατόπιν αιτήματος της Juana Romana de Torres και του συζύγου της, καπετάνιου Juan Bautista Panduro. Στη θέση αυτή ήταν η αδελφότητα της Παναγίας της Μοναξιάς και του Αγίου Τάφου, καταλαμβάνοντας ένα παρεκκλήσι αφιερωμένο στο Σαν Φρανσίσκο Xavier. Ο ναός και το σχολείο του Σαν Ντιέγκο, έργο του αιώνα XVII. η πρώτη με μια πολύ νηφάλια πρόσοψη που φαίνεται να ανήκει ήδη στο νεοκλασικό στυλ και η δεύτερη με μια όμορφη στοά που κοσμούν το παλιό μοναστήρι της.
Η εκκλησία του Jesús María, συνδεδεμένη με το μοναστήρι του ίδιου ονόματος, ιδρύθηκε το 1722. διατηρεί ακόμα τις μπαρόκ προσόψεις του, στις οποίες μπορείτε να δείτε μεγάλα γλυπτά που αντιπροσωπεύουν τη Σαγράδα Φαμίλια, το Βιρτζέν ντε λα Λουζ, το Σαν Φρανσίσκο και το Σάντο Ντομίνγκο.
Τέλος, είναι σημαντικό να επισημανθούν τρεις ακόμη θρησκευτικές κατασκευές που έχουν αναδειχθεί ως τα καλύτερα παραδείγματα, το καθένα από τα είδη του, της ανάπτυξης της αποικιακής αρχιτεκτονικής στη Γκουανταλαχάρα, κυρίως μεταξύ του 17ου και του δέκατου όγδοου αιώνα. Έτσι έχουμε το παρεκκλήσι Aránzazu, από τα μέσα του 18ου αιώνα, με το περίεργο καμπαναριό του και το εσωτερικό του διακοσμημένο με υπέροχους πίνακες ζωγραφικής και αλουμίνια Churrigueresque από την ίδια περίοδο και θεωρήθηκε το καλύτερο στην πόλη. Το μοναστήρι και η εκκλησία της Santa Mónica, που ιδρύθηκε από τον πατέρα Feliciano Pimentel στο πρώτο μισό του 18ου αιώνα. Ο ναός του παρουσιάζει μια διπλή πρόσοψη με πλούσια διακόσμηση που καταγράφεται ως το καλύτερο παράδειγμα του πληθωρικού στιλ Σολομονικού Μπαρόκ. Ο ναός του San Felipe Neri, που χτίστηκε το 1766 από τον αρχιτέκτονα Pedro Ciprés, σχηματίζει ένα σύνολο εξαιρετικής ηρεμίας που ενσωματώνει στοιχεία με αναμνήσεις Plateresque στη διακόσμηση, μια πτυχή που τοποθετεί τον ναό ως το καλύτερο θρησκευτικό κτίριο στη Γκουανταλαχάρα.
Στις κατασκευές που αντιστοιχούν στην πολιτική αρχιτεκτονική, υπάρχουν μερικά αξιοθαύμαστα κτίρια, μεταξύ των οποίων μπορούμε να αναφέρουμε το κυβερνητικό παλάτι, παλιά βασιλικά σπίτια που τροποποιήθηκαν τον 18ο αιώνα μετά από ένα έργο του στρατιωτικού μηχανικού Juan Francisco Espino, αν και η πρόσοψη ήταν έργο του Miguel José Conique. Το κτίριο σχεδιάστηκε ουσιαστικά σε μπαρόκ στιλ, αλλά ορισμένες νεοκλασικές τάσεις είναι ήδη αισθητές σε αυτό. Τα βασιλικά γραφεία, που βρίσκονταν στο εξαφανισμένο Palacio de Medrano, και οι αίθουσες λειτουργούσαν στις εγκαταστάσεις.
Έχουμε επίσης αυτό που ήταν το Εκπαιδευτικό Σεμινάριο αφιερωμένο στο Σαν Χοσέ, που εγκαινιάστηκε από τον Επίσκοπο Γκλέντο και Τσάβες το 1701, το οποίο σήμερα καταλαμβάνεται από το Περιφερειακό Μουσείο της Γκουανταλαχάρα, με το κύριο μοναστήρι κολώνων Τοσκάνης και τις μπαρόκ πόρτες. Το διάσημο Hospicio Cabañas χτίστηκε στις αρχές του 19ου αιώνα, ακολουθώντας τα σχέδια του περίφημου αρχιτέκτονα Manuel Tolsá, σκηνοθετώντας το έργο José Gutiérrez και ολοκληρώθηκε χρόνια αργότερα από τον αρχιτέκτονα Gómez Ibarra, και το οποίο αποτελεί αξιοσημείωτο παράδειγμα του νεοκλασικού στυλ.
Μεταξύ άλλων μικρών κατασκευών που παρείχαν στυλιστική ενότητα στην πόλη της Γκουανταλαχάρα, μπορούμε να αναφέρουμε, αν και δεν σώζονται όλα: το αρχοντικό του 16ου αιώνα που βρισκόταν μπροστά από αυτό που κάποτε ήταν η πλατεία του Σαν Σεμπαστιάν στη γειτονιά του Analco. Το σπίτι στην Calle de la Alhóndiga No. 114, επί του παρόντος Pino Suárez. Οι κατοικίες που ανήκαν στην οικογένεια Sánchez Leñero στο νούμερο 37 και εκείνες του κ. Dionisio Rodríguez στο αρ. 133 στην Calle de Alcalde. Το σπίτι Calderón, ένα παραδοσιακό αποικιακό κατάστημα καραμελών που ιδρύθηκε το 1729 και βρίσκεται στη γωνία των παλιών δρόμων της Santa Teresa και του Santuario, σήμερα Morelos και Pedro Loza. αυτό του Francisco Velarde, σε νεοκλασικό στιλ, και τελικά αυτό που ήταν το αρχοντικό Cañedo, που βρίσκεται μπροστά από το πίσω μέρος του καθεδρικού ναού.
Κοντά στη Γκουανταλαχάρα, την τρίτη πιο σημαντική πόλη της χώρας, βρίσκεται η παλιά πόλη του Σαν Χουάν Μπάουτιστα Μελζκουιτιλάν, σήμερα Σαν Χουάν ντε Λος Λάγος. Αυτή η πόλη έχει γίνει ένα σημαντικό θρησκευτικό κέντρο λόγω της θαυματουργής παράδοσης της εικόνας της Παναγίας που διατηρεί τη βασιλική της, που χτίστηκε στα μέσα του 17ου αιώνα από τον Don Juan Rodríguez Estrada. Στην ίδια πόλη μπορείτε να δείτε και άλλες κατασκευές όπως ο Ναός της Τρίτης Τάξης, το Παρεκκλήσι του Γολγοθά, το Παρεκκλήσι του Πρώτου Θαύματος, που χρονολογείται από τον 17ο και τον 18ο αιώνα. Υπάρχουν επίσης σημαντικά αστικά κτίρια στον πληθυσμό, όπως το Ανάκτορο του Κολλεγίου και το κτίριο των Τιτάνων, μεταξύ άλλων.
Στην πόλη του Lagos de Moreno μπορείτε να δείτε την κύρια ενορία της, έργο του 17ου αιώνα με μια όμορφη πρόσοψη σε στιλ Churrigueresque.
Τέλος, στο San Pedro Tlaquepaque υπάρχουν μερικά παραδείγματα μπαρόκ θρησκευτικής αρχιτεκτονικής στην περιοχή, όπως η ενορία του San Pedro και ο ναός του Soledad.
